在日本注册商标的流程通常包括以下步骤：

1. 商标搜索： 在开始注册流程之前，进行商标搜索是关键的一步。这有助于确认所申请商标是否已经被他人注册，以避免可能的冲突。

2. 委托代理人： 非居住在日本的外国人通常需要委托在日本注册商标的代理人。代理人可以是专业的商标代理机构或律师事务所。

3. 递交商标申请： 商标申请可以在线提交给日本专利厅（Japan Patent Office，JPO）或通过邮寄纸质申请表格。申请中需包含商标的图形、商品或服务的类别等信息。

4. 形式审查： JPO会进行商标申请的形式审查，确保提交的文件完整且符合要求。

5. 实质审查： 通过形式审查后，商标将接受实质审查，以确保其不与已注册商标相冲突，并符合法定要求。

6. 公告： 通过实质审查后，商标将被公告，允许公众提出异议。

7. 异议程序： 如果有人对商标注册提出异议，将进行异议程序。这可能导致商标注册被拒绝或需进行修改。

8. 注册证书颁发： 如果没有异议或在异议解决后，商标注册成功，将颁发商标注册证书。

至于费用，商标注册的费用取决于多个因素，包括商标的类别、注册地区等。一般而言，注册费、代理费、搜索费等都会计入总费用。费用也可能因是否有异议程序而有所变化。

要获取最准确的信息，建议直接咨询日本专利厅或专业商标代理机构，因为费用和流程可能会有变化。